利用条件

当データベース(以下、データベース)は、Open Database License(ODbL)の下で利用可能です。

あなたは自由に

  • 共有: データベースを複製、頒布及び利用することができます。
  • 創作: データベースから著作物を製作することができます。
  • 翻案: データベースへの改変、変形及び加工ができます。

あなたの従うべき条件は以下の通りです。

  • 表示: あなたはデータベースを公衆利用する場合、又はデータベースから著作物を製作する場合にはODbLで指定された方式に従い、帰属（クレジット）表示をしなければなりません。データベースを利用若しくは再頒布する場合、又はデータベースから著作物を製作する場合、あなたは、あなたのデータベースのライセンスを他者に対して明示するとともに、原データベース上のあらゆる通告を保持しておく必要があります。
  • 継承: あなたは、本データベースの翻案版、又は翻案版データベースから製作した著作物を公開利用する場合、その翻案版データベースもODbLに基づき提供しなければなりません。
  • キープ・オープン: あなたは、データベース、又はデータベースの翻案版を再頒布する場合、それらに制限をかける技術的手段（DRMなど）を用いることができます。ただし、あなたは、当該手段を使用していないバージョンも再頒布しなければなりません。

データベースに取り込まれた各データ（コンテンツ）の利用にあたっては、下記のデータの輩出元のライセンスに従ってください。

上記は一般の人に読みやすいようにした要約です。日本語訳はOpenStreetMap Japan(OSMJ)による日本語試訳を参考にしました。
適用される実際のライセンス条件については、ODbL 1.0ライセンス契約の全文（OSMJによる日本語試訳はこちら)を参照してください。
また、帰属表示は帰属（クレジット）表示例を参考にしてください。
ライセンス表示は、ODbLライセンスの採用例の表記を参考にしてください。

帰属（クレジット）の表示例

  1. TogoVarデータベースの利用に対する引用方法

    以下の論文を引用をしてください。
    Mitsuhashi N, Toyo-Oka L, Katayama T, Kawashima M, Kawashima S, Miyazaki K, Takagi T. TogoVar: A comprehensive Japanese genetic variation database. Hum Genome Var. 2022 Dec 12;9(1):44. doi: 10.1038/s41439-022-00222-9. PMID: 36509753; PMCID: PMC9744889.

  2. TogoVarデータベースに取り込まれた各データ（コンテンツ）の引用方法

    利用するコンテンツに応じて以下の引用をしてください。正式には各コンテンツの利用条件を参照ください。
    ClinVar [利用条件: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/docs/maintenance_use/]
    Landrum MJ, Chitipiralla S, Brown GR, et al. ClinVar: improvements to accessing data. Nucleic Acids Res. 2020;48(D1):D835-D844. doi:10.1093/nar/gkz972 https://doi.org/10.1093/nar/gkz972
    Colil [利用条件: http://colil.dbcls.jp/portal/index_en.html]
    T. Fujiwara and Y. Yamamoto, "Colil: a database and search service for citation contexts in the life sciences domain.", Journal of Biomedical Semantics, 6:38 (19 October 2015). https://doi.org/10.1186/s13326-015-0037-x
    GEM Japan Whole Genome Aggregation (GEM-J WGA) [利用条件: https://togovar.org/doc/datasets/gem_j_wga]
    "GEM Japan Whole Genome Aggregation (GEM-J WGA) Panel". Japan:GEnome Medical alliance Japan Project (GEM-J). Available from: https://togovar.org/doc/datasets/gem_j_wga.
    gnomAD [利用条件: https://gnomad.broadinstitute.org/about]
    Karczewski, K.J., Francioli, L.C., Tiao, G. et al. The mutational constraint spectrum quantified from variation in 141,456 humans. Nature 581, 434–443 (2020). https://doi.org/10.1038/s41586-020-2308-7
    GWAS Catalog [利用条件: https://www.ebi.ac.uk/gwas/docs/about]
    Sollis E, Mosaku A, Abid A, et al. The NHGRI-EBI GWAS Catalog: knowledgebase and deposition resource. Nucleic Acids Res. 2023;51(D1):D977-D985. https://doi.org/10.1093/nar/gkac1010
    HGNC [利用条件: https://www.genenames.org/about/license/]
    Seal RL, Braschi B, Gray K, et al. Genenames.org: the HGNC resources in 2023. Nucleic Acids Res. 2023;51(D1):D1003-D1009. https://doi.org/10.1093/nar/gkac888
    HGVD Release Version 2.30 (2017/08/02) [利用条件: http://www.hgvd.genome.med.kyoto-u.ac.jp/about.html]
    K. Higasa et al. "Human genetic variation database, a reference database of genetic variations in the Japanese population" J Hum Genet 61:547-553, 2016. https://doi.org/10.1038/jhg.2016.12
    JGA-SNP dataset [利用条件: https://togovar.org/doc/datasets/jga_snp]
    Variant set aggregated from NGS data in the NBDC Human Database/JGA [Internet]. Chiba: Database Center for Life Science (DBCLS), Joint Support-Center for Data Science Research, Research Organization of Information and System (Japan); [2018] - . JGA-SNP dataset; [cited YYYY Mmm DD]. Available from: https://togovar.org/doc/datasets/jga_snp
    JGA-WES dataset [利用条件: https://togovar.org/doc/datasets/jga_wes]
    Variant set aggregated from NGS data in the NBDC Human Database/JGA [Internet]. Chiba: Database Center for Life Science (DBCLS), Joint Support-Center for Data Science Research, Research Organization of Information and System (Japan); [2018] - . JGA-WES dataset; [cited YYYY Mmm DD]. Available from: https://togovar.org/doc/datasets/jga_wes
    JGA-WGS dataset [利用条件: https://togovar.org/doc/datasets/jga_wgs]
    Variant set aggregated from NGS data in the NBDC Human Database/JGA [Internet]. Chiba: Database Center for Life Science (DBCLS), Joint Support-Center for Data Science Research, Research Organization of Information and System (Japan); [2018] - . JGA-WGS dataset; [cited YYYY Mmm DD]. Available from: https://togovar.org/doc/datasets/jga_wgs
    LitVar [利用条件: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/home/about/policies/]
    Allot A, Peng Y, Wei CH, Lee K, Phan L, Lu Z. LitVar: a semantic search engine for linking genomic variant data in PubMed and PMC. Nucleic Acids Res. 2018;46(W1):W530-W536. https://doi.org/10.1093/nar/gky355
    MGeND [利用条件: https://mgend.ncgm.go.jp/ja/about#data-link]
    Mayumi Kamada, Masahiko Nakatsui, Ryosuke Kojima, Sachio Nohara, Eiichiro Uchino, Shigeki Tanishima, Masaya Sugiyama, Kenjiro Kosaki, Katsushi Tokunaga, Masashi Mizokami, Yasushi Okuno (2019) “MGeND: an integrated database for Japanese clinical and genomic information”, Human Genome Variation, 6, 53 (2019). https://doi.org/10.1038/s41439-019-0084-4
    PubTator Central [利用条件: https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/lu/PubTatorCentral/README.txt]
    Wei CH, Allot A, Leaman R, Lu Z. PubTator central: automated concept annotation for biomedical full text articles. Nucleic Acids Res. 2019 Jul 2;47(W1):W587-W593. https://doi.org/10.1093/nar/gkz389
    ToMMo 54KJPN Allele Frequency Panel (54KJPN) [利用条件: https://jmorp.megabank.tohoku.ac.jp/help/conditions-of-use]
    Tadaka et al., "jMorp updates in 2020: large enhancement of multi-omics data resources on the general Japanese population", Nucleic Acids Research. 2021 Jan 8;49(D1):D536-D544. https://doi.org/10.1093/nar/gkaa1034

ODbLライセンスの採用例